Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRKQ15262 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRKQ15262 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
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