Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms