Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PRKD1Q15139 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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