Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDK3Q15120 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK3Q15120 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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