Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPD2Q15021 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms