Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LAPTM4AQ15012 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms