Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHD4Q14839 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD4Q14839 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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