Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE4AQ14139 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE4AQ14139 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms