Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCINQ13939 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCINQ13939 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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