Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
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SHROOM2Q13796 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
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SHROOM2Q13796 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
SHROOM2Q13796 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
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SHROOM2Q13796 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
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SHROOM2Q13796 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
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SHROOM2Q13796 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
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SHROOM2Q13796 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
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SHROOM2Q13796 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHROOM2Q13796 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
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