Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKD2Q13563 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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PKD2Q13563 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
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PKD2Q13563 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKD2Q13563 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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