Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SP140Q13342 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SP140Q13342 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SP140Q13342 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SP140Q13342 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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SP140Q13342 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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SP140Q13342 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SP140Q13342 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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SP140Q13342 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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SP140Q13342 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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SP140Q13342 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SP140Q13342 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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