Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP2Q13309 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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