Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RIGQ13278 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RIGQ13278 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RIGQ13278 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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