Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3FQ13275 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3FQ13275 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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