Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME3Q13232 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME3Q13232 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NME3Q13232 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NME3Q13232 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NME3Q13232 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NME3Q13232 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NME3Q13232 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NME3Q13232 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NME3Q13232 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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