Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIN2BQ13224 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
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