Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ECH1Q13011 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms