Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BNIP3Q12983 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BNIP3Q12983 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms