Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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