Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TROQ12816 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TROQ12816 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TROQ12816 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TROQ12816 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TROQ12816 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TROQ12816 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TROQ12816 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TROQ12816 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TROQ12816 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TROQ12816 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TROQ12816 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TROQ12816 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TROQ12816 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TROQ12816 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TROQ12816 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TROQ12816 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TROQ12816 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TROQ12816 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TROQ12816 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TROQ12816 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TROQ12816 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TROQ12816 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TROQ12816 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TROQ12816 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TROQ12816 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TROQ12816 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TROQ12816 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TROQ12816 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TROQ12816 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TROQ12816 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TROQ12816 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TROQ12816 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TROQ12816 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TROQ12816 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TROQ12816 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TROQ12816 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TROQ12816 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TROQ12816 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TROQ12816 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TROQ12816 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TROQ12816 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TROQ12816 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TROQ12816 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
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