Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
FOXO1Q12778 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXO1Q12778 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms