Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE4CQ08493 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms