Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CYP4F3Q08477 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms