Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PLOD1Q02809 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms