Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms