Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MS4A2Q01362 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A2Q01362 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms