Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F1Q01094 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F1Q01094 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms