Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCL7P80098 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms