Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VBP1P61758 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VBP1P61758 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VBP1P61758 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VBP1P61758 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms