Protein–RNA interactions for Protein: P61160

ACTR2, Actin-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR2P61160 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTR2P61160 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTR2P61160 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTR2P61160 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTR2P61160 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTR2P61160 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTR2P61160 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR2P61160 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTR2P61160 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms