Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVPABLB-1P60509 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms