Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CABP4P57796 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABP4P57796 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CABP4P57796 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABP4P57796 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABP4P57796 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABP4P57796 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABP4P57796 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABP4P57796 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABP4P57796 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABP4P57796 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABP4P57796 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABP4P57796 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CABP4P57796 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CABP4P57796 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CABP4P57796 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CABP4P57796 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CABP4P57796 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CABP4P57796 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CABP4P57796 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CABP4P57796 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CABP4P57796 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CABP4P57796 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CABP4P57796 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms