Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SH3BGRP55822 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms