Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLTPP55058 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLTPP55058 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PLTPP55058 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PLTPP55058 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PLTPP55058 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PLTPP55058 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PLTPP55058 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PLTPP55058 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PLTPP55058 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PLTPP55058 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms