Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRAP54198 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRAP54198 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRAP54198 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRAP54198 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRAP54198 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIRAP54198 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRAP54198 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRAP54198 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRAP54198 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRAP54198 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRAP54198 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRAP54198 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRAP54198 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRAP54198 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRAP54198 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRAP54198 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRAP54198 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRAP54198 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRAP54198 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRAP54198 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRAP54198 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRAP54198 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIRAP54198 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIRAP54198 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIRAP54198 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIRAP54198 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRAP54198 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRAP54198 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRAP54198 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRAP54198 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRAP54198 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRAP54198 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRAP54198 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRAP54198 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIRAP54198 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms