Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSBP53539 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSBP53539 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSBP53539 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSBP53539 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms