Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RND2P52198 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RND2P52198 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RND2P52198 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RND2P52198 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RND2P52198 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RND2P52198 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RND2P52198 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RND2P52198 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RND2P52198 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RND2P52198 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RND2P52198 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RND2P52198 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RND2P52198 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RND2P52198 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RND2P52198 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RND2P52198 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RND2P52198 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RND2P52198 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RND2P52198 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RND2P52198 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RND2P52198 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms