Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRE11P49959 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRE11P49959 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRE11P49959 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRE11P49959 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms