Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP153P49790 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP153P49790 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP153P49790 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP153P49790 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP153P49790 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP153P49790 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP153P49790 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP153P49790 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP153P49790 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP153P49790 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP153P49790 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP153P49790 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP153P49790 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP153P49790 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP153P49790 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP153P49790 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP153P49790 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP153P49790 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP153P49790 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP153P49790 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP153P49790 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP153P49790 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP153P49790 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NUP153P49790 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP153P49790 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP153P49790 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP153P49790 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP153P49790 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP153P49790 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP153P49790 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP153P49790 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP153P49790 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NUP153P49790 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NUP153P49790 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NUP153P49790 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms