Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VEGFBP49765 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VEGFBP49765 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms