Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD4P46934 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD4P46934 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms