Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP5P45974 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP5P45974 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP5P45974 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP5P45974 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP5P45974 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms