Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR1BP42025 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms