Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms