Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SFTPDP35247 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFTPDP35247 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms