Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL9P32969 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL9P32969 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL9P32969 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL9P32969 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RPL9P32969 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL9P32969 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL9P32969 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL9P32969 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL9P32969 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL9P32969 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL9P32969 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL9P32969 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms