Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPS1P31327 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CPS1P31327 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPS1P31327 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPS1P31327 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPS1P31327 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPS1P31327 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CPS1P31327 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPS1P31327 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPS1P31327 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPS1P31327 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPS1P31327 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPS1P31327 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPS1P31327 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPS1P31327 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPS1P31327 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPS1P31327 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CPS1P31327 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CPS1P31327 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CPS1P31327 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CPS1P31327 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CPS1P31327 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CPS1P31327 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CPS1P31327 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPS1P31327 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPS1P31327 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPS1P31327 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPS1P31327 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPS1P31327 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPS1P31327 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPS1P31327 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPS1P31327 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CPS1P31327 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPS1P31327 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPS1P31327 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPS1P31327 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPS1P31327 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPS1P31327 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPS1P31327 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPS1P31327 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPS1P31327 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPS1P31327 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPS1P31327 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPS1P31327 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CPS1P31327 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms