Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HOXD3P31249 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXD3P31249 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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