Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSFA2P28290 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSFA2P28290 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms